A plataforma Open Journal System (OJS), através da qual a revista é administrada na nuvem com a modalidade Software as a Service (SaaS) desenvolvida pelo Public Knowledge Project (PKP), permite a preservação digital. Por outro lado, a revista é publicada em arquivos digitais, tais como REDIB e RedAlyC.
A biblioteca da Universidade de Manizales guarda todas as edições da revista Archivos de Medicina em seu arquivo digital. O Departamento de Gestão Documental e Informação da Universidade de Manizales é responsável pela gestão do arquivo central e do arquivo histórico da instituição, de acordo com o decreto 2609 de 2012.