A plataforma Open Journal System (OJS), por meio da qual a revista é administrada na nuvem na modalidade Software as a Service (SaaS), desenvolvida pelo Public Knowledge Project (PKP), permite a preservação digital. Além disso, a revista é publicada em repositórios digitais como o REDIB e o RedAlyC.
A biblioteca da Universidade de Manizales mantém todas as edições da revista Archivos de Medicina em seu arquivo digital, bem como as diferentes versões dos artigos publicados, os quais, por sua vez, são monitorados de acordo com a política Crossmark. O Departamento de Gestão Documental e Informação da Universidade de Manizales é responsável pela gestão do arquivo central e do arquivo histórico da instituição, de acordo com o decreto 2609 de 2012.