A plataforma Open Journal System (OJS), por meio da qual a revista é administrada na nuvem na modalidade Software as a Service (SaaS), desenvolvida pelo Public Knowledge Project (PKP), permite a preservação digital. Além disso, a revista é publicada em arquivos digitais como o REDIB e o RedAlyC.
A biblioteca da Universidade de Manizales mantém todas as edições da revista Archivos de Medicina em seu arquivo digital. O Departamento de Gestão Documental e d e Informação da Universidade de Manizales é responsável pela gestão do arquivo central e do arquivo histórico da instituição, de acordo com o decreto 2609 de 2012.