La plataforma Open Journal System (OJS) mediante la cual se administra la revista en la nube con la modalidad Software as a Service (SaaS) desarrollado por el Public Knowledge Project (PKP) permite la preservación digital. Por otra parte, la revista se publica en archivos digitales tales como REDIB y RedAlyC. 

La biblioteca de la Universidad de Manizales guarda todas las ediciones de la revista Archivos de Medicina en su archivo digital. La dependencia de Gestión Documental e Información de la Universidad de Manizales se encarga de gestionar el archivo central y el archivo histórico de la institución de acuerdo con el decreto 2609 de 2012.